MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015942	CGG	2	6	228953	228958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
4502	NC_015942	GCG	2	6	228959	228964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
4503	NC_015942	ATCCGC	2	12	228970	228981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344198449
4504	NC_015942	GCGT	2	8	229019	229026	0 %	25 %	50 %	25 %	344198449
4505	NC_015942	GCG	2	6	229052	229057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
4506	NC_015942	TCG	2	6	229079	229084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198449
4507	NC_015942	GGC	2	6	229138	229143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198449
4508	NC_015942	GCGG	2	8	229209	229216	0 %	0 %	75 %	25 %	344198450
4509	NC_015942	CGG	2	6	229243	229248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198450
4510	NC_015942	GCC	3	9	229389	229397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198450
4511	NC_015942	CTG	2	6	229399	229404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198450
4512	NC_015942	CTG	2	6	229427	229432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198450
4513	NC_015942	CCA	2	6	229439	229444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198450
4514	NC_015942	GAA	2	6	229445	229450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198450
4515	NC_015942	CCG	2	6	229456	229461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198450
4516	NC_015942	CAGC	2	8	229490	229497	25 %	0 %	25 %	50 %	344198450
4517	NC_015942	T	6	6	229510	229515	0 %	100 %	0 %	0 %	344198450
4518	NC_015942	A	6	6	229675	229680	100 %	0 %	0 %	0 %	344198451
4519	NC_015942	CGG	2	6	229699	229704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
4520	NC_015942	CG	3	6	229793	229798	0 %	0 %	50 %	50 %	344198451
4521	NC_015942	CGGAGG	2	12	229825	229836	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344198451
4522	NC_015942	ATC	2	6	229953	229958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198451
4523	NC_015942	AAG	2	6	229971	229976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198451
4524	NC_015942	TCC	2	6	230119	230124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198451
4525	NC_015942	CCA	2	6	230168	230173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198451
4526	NC_015942	CTG	2	6	230217	230222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
4527	NC_015942	CGG	3	9	230229	230237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
4528	NC_015942	TGC	2	6	230245	230250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
4529	NC_015942	TGC	2	6	230258	230263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
4530	NC_015942	ACC	2	6	230277	230282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198451
4531	NC_015942	AGA	2	6	230518	230523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198451
4532	NC_015942	TCG	2	6	230578	230583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
4533	NC_015942	GC	3	6	230675	230680	0 %	0 %	50 %	50 %	344198451
4534	NC_015942	TGC	2	6	230704	230709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198451
4535	NC_015942	GC	4	8	230738	230745	0 %	0 %	50 %	50 %	344198451
4536	NC_015942	GTG	2	6	230829	230834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198451
4537	NC_015942	CGC	2	6	230911	230916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198451
4538	NC_015942	TCGG	2	8	230920	230927	0 %	25 %	50 %	25 %	344198451
4539	NC_015942	GGTGCT	2	12	230939	230950	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344198451
4540	NC_015942	GGC	2	6	230963	230968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198451
4541	NC_015942	GC	3	6	230967	230972	0 %	0 %	50 %	50 %	344198451
4542	NC_015942	GCC	2	6	231009	231014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198451
4543	NC_015942	GC	3	6	231020	231025	0 %	0 %	50 %	50 %	344198451
4544	NC_015942	TCC	3	9	231075	231083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198452
4545	NC_015942	TGC	2	6	231084	231089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198452
4546	NC_015942	GCC	2	6	231136	231141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198452
4547	NC_015942	CTG	2	6	231225	231230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198452
4548	NC_015942	GCG	2	6	231337	231342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4549	NC_015942	G	6	6	231379	231384	0 %	0 %	100 %	0 %	344198453
4550	NC_015942	TGC	2	6	231497	231502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4551	NC_015942	CGG	2	6	231507	231512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4552	NC_015942	T	6	6	231530	231535	0 %	100 %	0 %	0 %	344198453
4553	NC_015942	TGC	2	6	231567	231572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4554	NC_015942	CGC	2	6	231579	231584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4555	NC_015942	CCG	3	9	231608	231616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4556	NC_015942	GCC	2	6	231640	231645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4557	NC_015942	AG	3	6	231732	231737	50 %	0 %	50 %	0 %	344198453
4558	NC_015942	C	6	6	231854	231859	0 %	0 %	0 %	100 %	344198453
4559	NC_015942	GGC	2	6	231867	231872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4560	NC_015942	ATG	2	6	231893	231898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198453
4561	NC_015942	ATCTGG	2	12	231929	231940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198453
4562	NC_015942	GCG	2	6	231941	231946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4563	NC_015942	ACG	2	6	231965	231970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4564	NC_015942	CCG	2	6	231986	231991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4565	NC_015942	GCG	2	6	232035	232040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4566	NC_015942	TGG	2	6	232064	232069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198453
4567	NC_015942	TGC	2	6	232082	232087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4568	NC_015942	GCAA	2	8	232121	232128	50 %	0 %	25 %	25 %	344198453
4569	NC_015942	GTG	2	6	232135	232140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198453
4570	NC_015942	GCC	2	6	232144	232149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4571	NC_015942	ATGA	2	8	232150	232157	50 %	25 %	25 %	0 %	344198453
4572	NC_015942	CTG	2	6	232159	232164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4573	NC_015942	TCG	2	6	232241	232246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198453
4574	NC_015942	GCG	2	6	232262	232267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4575	NC_015942	GGC	2	6	232293	232298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4576	NC_015942	GCC	2	6	232370	232375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4577	NC_015942	C	7	7	232380	232386	0 %	0 %	0 %	100 %	344198453
4578	NC_015942	CGG	2	6	232398	232403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198453
4579	NC_015942	CGC	3	9	232423	232431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198453
4580	NC_015942	TCTG	2	8	232710	232717	0 %	50 %	25 %	25 %	344198454
4581	NC_015942	CAG	2	6	232728	232733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198454
4582	NC_015942	CCG	2	6	232807	232812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198454
4583	NC_015942	ATT	2	6	232834	232839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198454
4584	NC_015942	TTA	2	6	232849	232854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198454
4585	NC_015942	CGC	2	6	232911	232916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198454
4586	NC_015942	CA	3	6	232947	232952	50 %	0 %	0 %	50 %	344198454
4587	NC_015942	GCGG	2	8	232958	232965	0 %	0 %	75 %	25 %	344198454
4588	NC_015942	GC	4	8	232982	232989	0 %	0 %	50 %	50 %	344198454
4589	NC_015942	CGG	2	6	233011	233016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198454
4590	NC_015942	GCC	2	6	233061	233066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198454
4591	NC_015942	ATTGGC	2	12	233136	233147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198454
4592	NC_015942	GC	3	6	233186	233191	0 %	0 %	50 %	50 %	344198454
4593	NC_015942	TTG	2	6	233221	233226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198454
4594	NC_015942	CGG	2	6	233260	233265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198454
4595	NC_015942	TCA	2	6	233290	233295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198454
4596	NC_015942	GGC	2	6	233378	233383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198454
4597	NC_015942	CTG	2	6	233634	233639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198454
4598	NC_015942	TAA	2	6	233651	233656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198454
4599	NC_015942	CAA	2	6	233727	233732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198454
4600	NC_015942	TAT	2	6	233801	233806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198454
4601	NC_015942	GCA	2	6	233831	233836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198454
4602	NC_015942	TCA	2	6	233855	233860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198454
4603	NC_015942	CGG	2	6	233986	233991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198454
4604	NC_015942	T	6	6	234040	234045	0 %	100 %	0 %	0 %	344198454
4605	NC_015942	AGT	2	6	234060	234065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198454
4606	NC_015942	GT	3	6	234064	234069	0 %	50 %	50 %	0 %	344198454
4607	NC_015942	GCTG	2	8	234071	234078	0 %	25 %	50 %	25 %	344198454
4608	NC_015942	CGC	2	6	234088	234093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198454
4609	NC_015942	TGG	2	6	234109	234114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198454
4610	NC_015942	ACG	2	6	234250	234255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198454
4611	NC_015942	CGA	2	6	234259	234264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198454
4612	NC_015942	CGC	2	6	234553	234558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198455
4613	NC_015942	TGA	2	6	234682	234687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198455
4614	NC_015942	ATG	2	6	234856	234861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198455
4615	NC_015942	CGCCAT	2	12	234863	234874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344198455
4616	NC_015942	CGG	2	6	234899	234904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198455
4617	NC_015942	TGA	2	6	234916	234921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198455
4618	NC_015942	TACAAC	2	12	235107	235118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	344198455
4619	NC_015942	CGA	2	6	235165	235170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198455
4620	NC_015942	TGG	2	6	235219	235224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198455
4621	NC_015942	GTC	2	6	235227	235232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198455
4622	NC_015942	CGCAG	2	10	235248	235257	20 %	0 %	40 %	40 %	344198455
4623	NC_015942	TGGC	2	8	235298	235305	0 %	25 %	50 %	25 %	344198455
4624	NC_015942	GGT	2	6	235334	235339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198455
4625	NC_015942	ACC	2	6	235389	235394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198455
4626	NC_015942	CAA	2	6	235425	235430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198455
4627	NC_015942	CTGT	2	8	235509	235516	0 %	50 %	25 %	25 %	344198455
4628	NC_015942	GGT	2	6	235550	235555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198455
4629	NC_015942	CTT	3	9	235770	235778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198456
4630	NC_015942	GGCT	2	8	235782	235789	0 %	25 %	50 %	25 %	344198456
4631	NC_015942	GCCG	2	8	235796	235803	0 %	0 %	50 %	50 %	344198456
4632	NC_015942	GTT	2	6	235947	235952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198456
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4634	NC_015942	T	7	7	236123	236129	0 %	100 %	0 %	0 %	344198456
4635	NC_015942	ATA	2	6	236156	236161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198456
4636	NC_015942	T	7	7	236256	236262	0 %	100 %	0 %	0 %	344198456
4637	NC_015942	GAT	2	6	236314	236319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198456
4638	NC_015942	TATAA	2	10	236349	236358	60 %	40 %	0 %	0 %	344198456
4639	NC_015942	GCC	2	6	236558	236563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198457
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4641	NC_015942	TGA	2	6	236628	236633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198457
4642	NC_015942	GCC	2	6	236672	236677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198457
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4646	NC_015942	ATC	2	6	236837	236842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198457
4647	NC_015942	GCAT	2	8	236877	236884	25 %	25 %	25 %	25 %	344198457
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4650	NC_015942	GTGG	2	8	237257	237264	0 %	25 %	75 %	0 %	344198458
4651	NC_015942	GGA	2	6	237304	237309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198458
4652	NC_015942	TAT	2	6	237332	237337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198458
4653	NC_015942	TCC	2	6	237346	237351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198458
4654	NC_015942	GGCGC	2	10	237421	237430	0 %	0 %	60 %	40 %	344198458
4655	NC_015942	GCA	2	6	237699	237704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198459
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4659	NC_015942	GTT	2	6	237888	237893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198459
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4673	NC_015942	GCAC	2	8	238854	238861	25 %	0 %	25 %	50 %	344198462
4674	NC_015942	CGG	3	9	238942	238950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198462
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4682	NC_015942	GCCA	2	8	239403	239410	25 %	0 %	25 %	50 %	344198463
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4693	NC_015942	GC	4	8	239860	239867	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4694	NC_015942	GCCA	2	8	239893	239900	25 %	0 %	25 %	50 %	344198463
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4698	NC_015942	TCGC	2	8	240134	240141	0 %	25 %	25 %	50 %	344198463
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4726	NC_015942	GC	3	6	241297	241302	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4727	NC_015942	CG	3	6	241308	241313	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4728	NC_015942	CGC	2	6	241368	241373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198463
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4730	NC_015942	GC	3	6	241430	241435	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4731	NC_015942	CCG	2	6	241454	241459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198463
4732	NC_015942	TGC	2	6	241477	241482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198463
4733	NC_015942	GC	3	6	241489	241494	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4734	NC_015942	GATC	2	8	241541	241548	25 %	25 %	25 %	25 %	344198463
4735	NC_015942	GCGG	2	8	241596	241603	0 %	0 %	75 %	25 %	344198463
4736	NC_015942	TGT	2	6	241612	241617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198463
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4738	NC_015942	CG	3	6	241705	241710	0 %	0 %	50 %	50 %	344198463
4739	NC_015942	T	6	6	242301	242306	0 %	100 %	0 %	0 %	344198464
4740	NC_015942	TGGCTG	2	12	242368	242379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344198464
4741	NC_015942	ACT	2	6	242384	242389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198464
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4743	NC_015942	TGT	2	6	242488	242493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198464
4744	NC_015942	GGC	2	6	242600	242605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198464
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4747	NC_015942	GCG	2	6	242745	242750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198464
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4764	NC_015942	TTG	2	6	243633	243638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198465
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4773	NC_015942	TGC	2	6	243968	243973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198466
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4775	NC_015942	GCC	2	6	244046	244051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198466
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4861	NC_015942	CAGAA	2	10	248758	248767	60 %	0 %	20 %	20 %	344198470
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4865	NC_015942	TA	3	6	249136	249141	50 %	50 %	0 %	0 %	344198471
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4984	NC_015942	CCG	2	6	255176	255181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198474
4985	NC_015942	GATG	2	8	255212	255219	25 %	25 %	50 %	0 %	344198474
4986	NC_015942	ACC	2	6	255225	255230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198474
4987	NC_015942	GCC	3	9	255264	255272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198474
4988	NC_015942	ATC	2	6	255328	255333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198474
4989	NC_015942	GCCA	2	8	255366	255373	25 %	0 %	25 %	50 %	344198474
4990	NC_015942	TGA	2	6	255374	255379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198474
4991	NC_015942	GGC	2	6	255390	255395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
4992	NC_015942	GCG	2	6	255436	255441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
4993	NC_015942	GTG	2	6	255442	255447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198474
4994	NC_015942	GC	3	6	255462	255467	0 %	0 %	50 %	50 %	344198474
4995	NC_015942	CGA	2	6	255512	255517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
4996	NC_015942	CATT	2	8	255526	255533	25 %	50 %	0 %	25 %	344198474
4997	NC_015942	TGT	2	6	255545	255550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198474
4998	NC_015942	CGG	2	6	255578	255583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
4999	NC_015942	GAC	2	6	255651	255656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
5000	NC_015942	TGC	2	6	255690	255695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198474

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